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福建地区角膜炎棘阿米巴的18S rDNA基因型鉴定           ★★★
福建地区角膜炎棘阿米巴的18S rDNA基因型鉴定
作者:朱学军 文章来源:福建医科大学附属第一医院眼科 点击数:358 更新时间:2011/9/13

目的  鉴定角膜炎患者棘阿米巴分离株的 18S核糖体DNA(18S rDNA ,Rns)基因型。
方法  取16例门诊拟诊为棘阿米巴角膜炎患者分离转种培养 16株致角膜炎的棘阿米巴虫株,提取虫株全基因组DNA,应用棘阿米巴属特异性引物,通过聚合酶链反应 (PCR)扩增部分18S rDNA序列。扩增产物测序后,采用分子生物学软件Clusta X和MEGA2对所测序列进行分析,与基因库中已有序列进行比较,分析福建地区角膜炎患者棘阿米巴分离虫株Rns基因型特点及与其他国家和地区虫株的基因型异同。
结果  对16株角膜刮除物标本培养阳性的棘阿米巴虫株PCR扩增,并测序后共得到16个分型序列3 (DF3序列)。14株 (87.5 % )属于RnsT4基因型,1株 (12.5% )属于RnsT3基因型。
结论  分离自角膜炎患者的棘阿米巴虫株根据Rns基因特点,多属于T4基因型,部分虫株属于T3基因型,这与在中国北方地区分离到的致角膜炎棘阿米巴虫株及与其他国家和地区分离到的致角膜炎虫株的Rns基因具有一定的相似性。可能进一步证实了某些基因的变异可能导致了该型的致病性,某些特殊的18S rDNA基因型具有较强的嗜角膜性而容易造成角膜的感染。

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